OmniOutliner の一般環境設定で自動バックアップ機能をオンにした場合、書類で作業を続けている間、一定の間隔でその時点の書類のバックアップが作成されます。マシンのクラッシュや停電、その他不測の事態に備えて書類の中にバックアップが作成されます。ファイルを再び開くと、最後に手動で保存した状態と自動バックアップで保存された状態のどちらを開くか尋ねられます。